Так уж повелось с давних времен, что наш сайт работал с использованием MySQL. И всебы ничего, но с переходом с версии 5.1 на 5.5 MySQL начал потреблять очень много памяти. Ковыряние конфига и смена MySQL на MariaDB не сильно решили проблему. Решено было переходить на PostgreSQL (да я знаю о фичастости этого сервера, но на сайте с не очень большой посещаемостью решающим стало именно потребление памяти).